นับตั้งแต่เริ่มตั้งกรมคลอง การปฏิบัติงานด้านพัสดุมีเพียงเจ้าหน้าที่เป็นชุดทำงาน ทำหน้าที่จัดหาพัสดุและอุปกรณ์ เพื่อนำมาใช้ในการก่อสร้างต่างๆ ที่มีอยู่ไม่มากนัก โดยปฏิบัติหน้าที่ตรงต่อผู้ควบคุมงานก่อสร้างของแต่ละโครงการ จนกระทั่งถึงสมัยกรมทดน้ำ จึงได้มีการจัดตั้งหน่วยงานระดับแผนกซึ่งรวมงานด้านพัสดุกับงานพาหนะทางน้ำไว้ด้วยกัน เรียกว่า "แผนกพัสดุและยานพาหนะทางน้ำ สังกัดกองบัญชี โดยยังคงมีหน่วยพัสดุประจำตามโครงการก่อสร้างทุกแห่งด้วย ต่อมาเมื่อภารกิจและเจ้าหน้าที่พัสดุเพิ่มมากขึ้น จึงได้แยกออกจากงานพาหนะทางน้ำเป็น "แผนกพัสดุ" สังกัดกองคลังใน พ.ศ.2478 และเมื่องานพัฒนาแหล่งน้ำของกรมชลประทานขยายกว้างขวางครอบคลุมทั่วทั้งประเทศ จึงได้ยกฐานะแผนกพัสดุขึ้นเป็น "กองพัสดุ" ใน พ.ศ.2495 เป็นต้นมา